本发明实施例公开了一种燃料电池汽车热管理系统及方法。其中，燃料电池汽车热管理系统，包括：燃料电池冷却装置、热泵空调装置、动力电池冷却装置和热换器组；所述燃料电池冷却装置：用于与所述动力电池冷却装置或所述热换器组交换热量；所述热泵空调装置：用于与所述燃料电池冷却装置、动力电池冷却装置或热换器组提供交换热量；在热泵空调装置提供暖风的初始状态时，所述热换器组，还用于提供初始热量。达到降低能耗且提高能量利用率的效果。